Matriu de Coincidències
|
Esquema General:
|
Esquema Matriu de Coincidències
1. Àrea de Treball
2. Botonera
|
 |
|
1. Àrea de Treball:
|
 |
Figura B.1 Matriu de Coincidències amb long. paraula = 3 |
A.Indicadors número de base ADN: Aquests números indiquen la posició de la base situada a sobre d'ells dins la cadena.
B.Indicadors base ADN: Aquí estan reflectides les bases de cadascuna de les cadenes (ADN 01 en vertical i ADN 02 en horitzontal).
C.Coincidències: En aquesta àrea quedaran reflectides les coincidències de bases, les bases coincidents es marcaran amb blau i els inicis de paraula coincident
es marcaran amb una "X".
D.Diagonal de Ràfega Màxima: Aquí es guarda per a cada diagonal, el número màxim de bases seguides que coincideixen a el diagonal. Al prémer al damunt de cadascuna de les caselles que la componen
es seleccionarà la diagonal pertinent.
E.Diagonal de Suma de Bases: Aquí s'indica el número de bases que coincideixen en el diagonal. Al prémer sobre cadascuna de les caselles que la componen
es seleccionarà el diagonal pertinent.
F.Diagonal de Suma de Diagonals: Agrupant en grups de tres els resultats de les sumes de bases per a cada diagonal, obtenim aquesta àrea numèrica, cercant els
valors màxims podem tenir una certa idea d'on hi ha coincidències. En general podem dir que ens interessen valors elevats en els extrems. Una vegada s'hi hagi omplert, al prémer sobre cadascuna de les sumes
es seleccionaran les diagonals de les que s'obté aquest resultat.
G.Àrea d'ocurrències impossibles: En aquesta àrea no hi poden haver coincidències, ja que aquí no hi caben coincidències iguals o superiors a la mínima ràfega buscada, que
està indicada por la longitud de paraula utilitzada.
|
|
2. Botonera:
|
 |
A.Pas (ALT+S): El que fa aquest botó és seleccionar
la següent paraula a consultar de la seqüència d'ADN situada en horitzontal y cercar-la a la taula de hash,
indicant la coincidència entre ambdues seqüències si n'hi ha.
B.Completar (ALT+C): Aquest botó omple completament la matriu de
coincidències (Disponible després de prémer Inici).
C.Repetir (ALT+R): Aquest botó neteja la matriu de coincidències
deixant-la com estava abans de començar a treballar sobre ella (Disponible després de prémer Inici).
D.Ajuda (ALT+H): Aquest document (Disponible després de prémer Inici).
|
|
Exemples d'Ús:
|
ADN 01: |
|
ACTTACGGTATCGT |
|
Long. Paraula |
|
2 |
ADN 02: |
|
ATTCGTAT |
|
|
|
|
|
|
 |
>> Paso >>
|
 |
>> Pas >>
|
 |
|
 |
>> Pas >>
|
 |
>> Completar >>
|
 |
|
 |
>> Pas >>
|
 |
>> Repetir >>
|
 |
|
 |
>> Completar >>
|
 |
>> Repetir >>
|
 |
|
 |
Seleccionem una columna de la Diagonal Max
|
 |
Seleccionem una columna de la Diagonal Pas
|
 |
|
 |
Seleccionem una columna de la Diagonal Pas
|
 |
Seleccionem la mateixa columna de nou
|
 |
|