AYUDA LePMA (Learning Progressive Multiple Alignment)
--Conceptos--

Formato Fasta
     El formato Fasta es el más extendido i aceptado en el mundo para la formalización de secuencias de cara a un tratamiento de datos unificado i estándard.
     Este formato consiste en introducir un nombre de secuencia precedido por el caracter '>' i, en la siguiente línea, la secuencia en cuestión representada por la sucesión de iniciales de los nucleótidos que la forman, o el caracter '-' para representar un gap. Esto se repite para cada secuencia que se quiera introducir.
    Por ejemplo:
        >s1
        atgact
        >s2
        cct-a

Árbol Guía (o Dendograma)
     Un dendograma o árbol guía es un árbol jerárquico, similar a un árbol filogenético, que muestra gráficamente la sucesión ordenada de alineamientos según las similitudes entre las secuencias i clústers implicados.

Matriz de Puntuaciones
     La matriz de puntuaciones es una matriz simétrica que nos muestra las puntuaciones de similitudes (o distancias) entre todo par de de secuencias o clústers en un momento dado del alineamiento múltiple.
     En el primer paso se obtienen las puntuaciones alineando todas las secuencias dos a dos. Pero a partir del segundo paso, se aplica una fórmula aproximatoria para calcular las similitudes respecto a los clústers que van apareciendo.

Matriz de Similitud
     Dadas dos secuencias, la matriz de similitud nos muestra una comparación de las dos carácter a carácter pudiendo observar que valor o similitud final se obtiene.
     En nuestra aplicación, esta matriz la podemos observar pulsando sobre cualquier valor de la primera matriz de puntuaciones (la del primer paso del alineamiento).