Matriz de Coincidencias

Esquema General:

Esquema Matriz de Coincidencias
1. Area Trabajo
2. Botonera

1. Area Trabajo:
Figura B.1 Matriz de Coincidencias con long. palabra = 3

A. Indicadores número de base ADN: Estos números indican la posición de la base situada encima de ellos dentro de la cadena.
B. Indicadores base ADN: Aquí están reflejadas las bases de cada una de las cadenas (ADN 01 en vertical y ADN 02 en horizontal).
C. Coincidencias: En esta área quedarán reflejadas las coincidencias de bases, las bases coincidentes se marcarán en azul y los inicios de palabras coincidentes se marcarán con una "X".
D. Diagonal de Ráfaga Máxima: Aquí se guarda para cada diagonal, el número máximo de bases seguidas que coinciden en ese diagonal. Al pulsar sobre cada una de las casillas que la componen se seleccionará el diagonal pertinente.
E. Diagonal de Suma de Bases: Aquí se indica en número de bases que coinciden en ese diagonal. Al pulsar sobre cada una de las casillas que la componen se seleccionará el diagonal pertinente.
F. Diagonal de Suma de diagonales: Agrupando en grupos de tres los resultados de las sumas de bases para cada diagonal, obtenemos esta área numérica, buscando los valores máximos podemos tener una cierta idea de donde hay coincidencias. En general podemos decir que nos interesan valores elevados en los extremos. Una vez se haya rellenado, al pulsar sobre cada una de las sumas se seleccionarán las diagonales de las que se obtiene este resultado.
G. Área de ocurrencias imposibles: En esta área no puede haber coincidencias, ya que aquí no caben coincidencias iguales o superiores a la mínima ráfaga buscada, que está indicada por la longitud de palabra utilizada.

2. Botonera:

A. Paso (ALT+S): Lo que hace este botón es seleccionar la siguiente palabra a consultar de la secuencia de ADN situada en horizontal y buscarla en la tabla de hash, indicando la coincidencia entre las dos secuencias si la hay.
B. Completar (ALT+C): Este botón rellena completamente la matriz de coincidencias (Disponible tras pulsar Inicio).
C. Repetir (ALT+R): Este botón limpia la matriz de coincidencias dejandola como estaba antes de empezar a trabajar sobre ella (Disponible tras pulsar Inicio).
D. Ayuda (ALT+H): Este documento (Disponible tras pulsar Inicio).

Ejemplos de Uso:
ADN 01: ACTTACGGTATCGT Long. Palabra 2
ADN 02: ATTCGTAT


>> Paso >>

>> Paso >>


>> Paso >>

>> Completar >>


>> Paso >>

>> Repetir >>


>> Completar >>

>> Repetir >>


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una columna
de el diagonal Max


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una columna
de el diagonal Pas



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una columna
de el diagonal Pas


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