AJUDA LePMA (Learning Progressive Multiple Alignment)
--Conceptes--

Format Fasta
    El format Fasta és el més estès i acceptat arreu del món amb el qual es formalitzen les seqüències de cara a un tractament de dades unificat i estàndard.
    Aquest format consisteix a introduir un nom de seqüència precedit pel caracter '>' i, a la següent línia, la seqüència en questió representada per la succeció d'inicials dels nucleòtids que la formen o el caràcter '-' per representar un gap. Això es repeteix per cada seqüència que es vulgui introduir.
    Per exemple:
        >s1
        atgact
        >s2
        cct-a

Arbre Guia (o Dendograma)
    Un dendograma o arbre guia és un arbre jeràrquic, similar a un arbre filogenètic, que mostra gràficament la succeció ordenada d'alineaments segons les similituds entre les seqüències i clusters implicats.

Matriu de Puntuacions
    La matriu de puntuacions és una matriu simètrica que ens mostra les puntuacions de similituds (o distàncies) entre tot parell de seqüències o clusters en un moment donat de l'alineament múltiple.
    En el primer pas s'obtenen les puntuacions alineant totes les seqüències dos a dos. Pero a partir del segon pas, s'aplica una fórmula aproximatòria per calcular les similituds respecte els clusters que van apareixent.

Matriu de Similitud
    Donades dues seqüències, la matriu de similitud ens mostra una comparació d'ambdues caràcter a caràcter podent observar quin valor o similitud final s'obté.
    En la nostra aplicació, aquesta matriu la podem observar clicant sobre qualsevol valor de la primera matriu de puntuacions (la del primer pas de l'alineament).